隨著第三代基因測(cè)序技術(shù)的引入，生物信息學(xué)的研究領(lǐng)域得以廣泛拓展，為深度挖掘基因信息提供了更多的可能性，同時(shí)，也帶來(lái)了海量的數(shù)據(jù)分析和處理任務(wù)。
北京希望組生物科技有限公司（下文簡(jiǎn)稱希望組）在打造全新的三代測(cè)序項(xiàng)目交付平臺(tái)時(shí)，引用火山引擎 Bio-OS 解決方案，建立了基于 web 的生信數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，不僅有效降低生信數(shù)據(jù)分析門檻，也使售后人力成本降低了40%，運(yùn)維成本降低了30%。
希望組（Grandomics）是全球知名的三代測(cè)序技術(shù)拓展者，也是中國(guó)首家三代測(cè)序服務(wù)公司。多年來(lái)，一直專注于在三代測(cè)序平臺(tái)上進(jìn)行技術(shù)開發(fā)與應(yīng)用拓展，其自主開發(fā)了基因組變異分析系統(tǒng)、單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)等多項(xiàng)三代測(cè)序軟件和技術(shù)，并構(gòu)建了三代測(cè)序高性能計(jì)算集群，為客戶提供優(yōu)質(zhì)的第三代測(cè)序分析和存儲(chǔ)服務(wù)。
圖片來(lái)源：希望組（Grandomics）官網(wǎng)
第三代測(cè)序發(fā)展迅速，底層調(diào)度迎來(lái)挑戰(zhàn)
近年來(lái)，第三代測(cè)序技術(shù)迅速發(fā)展，為基因組研究提供了高分辨率的數(shù)據(jù)。希望組致力于打造一個(gè)三代測(cè)序項(xiàng)目交付平臺(tái)，通過(guò)可視化界面幫助用戶進(jìn)行生信數(shù)據(jù)分析，降低難度、提高效率。然而，生信數(shù)據(jù)分析流程復(fù)雜，計(jì)算任務(wù)多且波動(dòng)大，需要處理海量非結(jié)構(gòu)化文件數(shù)據(jù)。因此，希望通過(guò)異構(gòu)集群納管調(diào)度能力，實(shí)現(xiàn)資源復(fù)用，降低成本，提升集群擴(kuò)容的便利性。
火山引擎Bio-OS，助力生信數(shù)據(jù)分析
生信數(shù)據(jù)分析平臺(tái)
在火山引擎 Bio-OS 解決方案的支持下，希望組成功構(gòu)建了基于 web 的生信數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。該平臺(tái)不僅能夠充分利用現(xiàn)有的本地計(jì)算資源進(jìn)行生信計(jì)算，同時(shí)也方便其客戶通過(guò) web 頁(yè)面提交自己所需的生信分析流程來(lái)獲取分析結(jié)果。該平臺(tái)擁有無(wú)縫集成彈性容器、海量實(shí)例快速秒級(jí)啟動(dòng)、靈活應(yīng)對(duì)計(jì)算高峰等特性。此外，這些特性的引入也有效地縮減了售后支持方面的人力成本。
生信數(shù)據(jù)分析平臺(tái)的三大優(yōu)勢(shì)：
降本增效，資源利用：希望組引入 Bio-OS 方案，通過(guò)將本地的 SGE 集群納入私有集群的管理范圍，將舊有的計(jì)算資源轉(zhuǎn)化為有價(jià)值的資源，進(jìn)一步提升計(jì)算效率，減少資源浪費(fèi)，降低維護(hù)成本。
流程簡(jiǎn)化，操作追溯：Bio-OS 通過(guò)在工作流中預(yù)置一系列分析步驟，希望組成功降低了生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析的門檻。實(shí)驗(yàn)人員和醫(yī)生等非專業(yè)人士也能夠輕松地啟動(dòng)復(fù)雜的數(shù)據(jù)分析流程，不需要深入了解技術(shù)細(xì)節(jié)。同時(shí)，通過(guò) git 管理工作流的不同版本，確保了操作的可追溯性和回顧性。
容器集群，智能管理：在計(jì)算資源管理方面，火山引擎的 Bio-OS 方案引入了彈性容器，使系統(tǒng)能夠快速啟動(dòng)和停止計(jì)算實(shí)例，以適應(yīng)計(jì)算任務(wù)的變化。特別是在處理計(jì)算高峰時(shí)，依然能夠保證系統(tǒng)高效運(yùn)行，不會(huì)因?yàn)樨?fù)載增加而陷入延遲。
售后成本降低40%，運(yùn)維成本降低30%
生信數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，有效降低了生信數(shù)據(jù)分析的門檻，讓普通人員也可輕松開啟數(shù)據(jù)分析之旅。另外，Bio-OS 納管本地 SGE 集群的功能實(shí)現(xiàn)本地算力的充分利用，在提升集群管理效率的同時(shí)，降低了40%售后支持人力成本和30%運(yùn)維成本。
目前，希望組在 Bio-OS 平臺(tái)集成的 notebook 工具基礎(chǔ)上，還開發(fā)了諸如花瓣圖、動(dòng)態(tài)火山圖、單細(xì)胞基因表達(dá)降維圖、單細(xì)胞降維分群圖工具等。隨著技術(shù)的不斷演進(jìn)，基因測(cè)序和 Bio-OS 的結(jié)合，將擴(kuò)展我們對(duì)基因組含義和應(yīng)用的理解，并創(chuàng)造出更多的發(fā)展機(jī)遇。
END
日前，火山引擎與基因會(huì)等六家生信領(lǐng)域企業(yè)，共同發(fā)布了《2023基因行業(yè)藍(lán)皮書》。未來(lái)，火山引擎將持續(xù)為科技研發(fā)提供支持，為生物信息領(lǐng)域的創(chuàng)新發(fā)展注入更多的動(dòng)力。
更多詳細(xì)內(nèi)容，請(qǐng)點(diǎn)擊閱讀原文，下載《2023基因行業(yè)藍(lán)皮書》。
閱讀原文鏈接：
https://www.volcengine.com/docs/6624/1109238
